genome-to-sqlite

将您的基因组导入 SQLite 数据库。

如何安装

$ pip install genome-to-sqlite

首先，导出您的基因组。该工具目前仅针对 23andMe 进行了测试。您可以从 https://you.23andme.com/tools/data/download/ 请求导出您的基因组。

现在您可以将生成的 export.zip 文件转换为 SQLite，如下所示

$ genome-to-sqlite export.zip genome.db

将显示一个进度条。您可以使用 --silent 禁用它。

Importing genome  [#----------------]    5%  00:01:33

您可以使用 Datasette 探索生成的数据，如下所示

$ datasette genome.db --config facet_time_limit_ms:1000

增加分面时间限制有助于按染色体启用分面功能